Στην πρώτη φάση πιθανόν τον 5ο μ.Χ αιώνα, η βασιλική κτίστηκε από ερείπια προγενέστερου ρωμαϊκού κτίσματος και ενσωμάτωσε τμήματα της ψηφιδωτής διακόσμησης των δαπέδων που προυπήχαν. Μια τρίκλιτη βασιλική διατηρείται από τη δεύτερη φάση.
Στην τρίτη φάση, σχεδιάζεται νέος τρίκλιτος ναός μεγάλων διαστάσεων σε ψηλότερο επίπεδο. Η τρίτη φάση θα μπορούσε να ανήκει στην εποχή του Κωνσταντίνου Δ` Πωγωνάτου (668-685), όπως άλλωστε αναφέρει και η παράδοση. Όμως δεν υπάρχουν ανασκαφικά δεδομένα που να το υποστηρίζουν.
Στην τέταρτη φάση η εκκλησία έγινε σταυροειδής με τρούλο και με ημικυκλική εσωτερικά και εξωτερικά την κόγχη του ιερού βήματος. Για τη χρονολογία της τέταρτης φάσης ο κώδικας του Αλατίου αναφέρεται στο σεισμό του 1389 ως terminus terminus ante quem.
Στην πέμπτη φάση προστέθηκε στο μέσον του βορείου τοίχους μιναρές. |